هزاران ماهی و بچه‌ماهی در پی قطع جریان آب زاینده‌رود در بخش‌هایی از بستر این رودخانه تلف شده‌اند.
جریان آب زاینده‌رود پس از ۹۴ روز، از بامداد ۱۵ شهریور و با کاهش خروجی سد به سمت پایین‌دست قطع شد. در پی کاهش آب، شمار زیادی از ماهی‌ها در مانداب‌های باقی‌مانده گرفتار شدند و بخشی از آنها به دلیل کمبود آب و اکسیژن از بین رفتند.
مقام‌های محیط زیست استان اصفهان با انتقاد از قطع و وصل دوره‌ای جریان زاینده‌رود گفته‌اند این شیوه مدیریت آب، حیات آبزیان و اکوسیستم رودخانه را با آسیب جدی روبه‌رو کرده است.
حسین اکبری، معاون محیط زیست طبیعی و تنوع زیستی استان اصفهان، گفته است شرکت آب منطقه‌ای باید مسئولیت پیامدهای ناشی از قطع جریان آب را بپذیرد. به گفته او، محیط زیست پیش از قطع آب درباره پیامدهای آن هشدار داده بود.
پس از انتشار تصاویر تلف شدن ماهی‌ها، گروه‌های محیط زیست عملیات جمع‌آوری و انتقال ماهی‌های باقی‌مانده در مانداب‌ها به مناطق دارای آب را آغاز کردند.
فعالان و مسئولان محیط زیست اصفهان خواستار تأمین حداقل جریان دائمی آب در زاینده‌رود شده‌اند تا از تکرار تلف شدن آبزیان جلوگیری شود.
